《数学荒岛历险记》讲述了数学岛是一座美丽、梦幻般的小岛，岛上生活着一群单纯、快乐的居民，还有一个爱搞怪的国王及他的四个性格奇特的数学手下——“加”“减”“乘”“除”，在数学岛上有一个神奇的愿望之码，通过五只奇异的宠物精灵“咔布”解开愿望之码后可以实现任何愿望。

性情古怪的数学博士为了实现统治数学世界的野心，一心想要得到五只咔布。数学天才罗克无意中从现实生活中来到了岛上，认识了岛上的好朋友依依以及拥有愿望兽的五个小孩，为他们带来了丰富的数学知识，罗克和伙伴们齐心协力，一次次地挫败博士的阴谋，恢复了数学岛的安宁。